Heinrich Fidelis Müller hat selbst keines seiner Oratorien instrumentiert. Die jeweiligen Instrumentationen werden in der folgenden Tabelle aufgeführt
Werk Instrumentator Besetzung Bezugsquelle
Weihnachtsoratorium op. 5 Winand Nick zeitgen. Fl./ Ob. / Streicher Dr. Butz - Musikverlag
Die heiligen Dreikönige op.7 Ulrich Moormann 2001 Sinfonieorchster HFM - Archiv
Die heiligen Dreikönige op.7 Ulrich Moormann 2002 Fl. / Ob. / 2 Trp. + Tp. ad. lib/ Streicher Dr. Butz - Musikverlag
Die heilige Elisabeth op. 12 Josef Lammertz 1987 Sinfonieorchester HFM - Archiv
Die heilige Elisabeth op. 12 Ulrich Moormann 2003 Streichorquartett HFM - Archiv
Johannespassion op. 16/17 (Supplement) Winand Nick zeitgen. Sinfonieorchester HFM - Archiv
Heliand op. 21 Winand Nick zeitgen. Sinfonieorchester HFM - Archiv
Emmanuel op. 28 Ulrich Moormann Sinfonieorchester HFM - Archiv